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如果编程语言是一种刀
下面这个图是把编程语言看做是一种刀，那么会是什么样的。
对于这个图，最好不要解释，意会就好。不过，忍不住想解释一下。
C++，C，Pascal 都是瑞士军刀，说明是用来做细活的工具。C语言的刀上有个USB，说明是可以做硬件操作的。C++的刀是什么都有，说明C++是一种功能繁多的语言。（图中C++的那把瑞士军刀很强大，不要以为其是虚构的，这把刀是真实存在的，叫Wenger巨人刀，淘宝上有卖的，价格在1万4左右。）
Java/C#是一把塑料餐刀，这说明，Java和C#语言是带虚拟机的，而且其语法和使用并不像C++那么复杂，其泛型编程可以有很多种玩法，而Java和C#的泛型编程是比较单一的。
Python是把电锯，人挡杀人，佛招杀佛，威力很大，面对大型的物体的修整，比C++/C/Java什么的得心应手得多得多，但是对于一些精细的调优工作，明显不行。这和Ruby很像。
PHP没有MySQL，明显是被幽默了一把。不过最近对PHP的批评越来越多，不过，facebook的PHP的引擎HiPo已经很牛B了。
Perl是一本日本武士刀，是忍者玩的语言。
VB，就是一个玩具。你见过用塑料玩具勺当刀的吗？
Haskell感觉是外星来的。
千万别惹程序员
这是一个有技术含量的号牌遮挡。我们先不说其是不是能奏效，不过，这个创意相当的NB啊。当你驾车通过某些路口时，被摄像头捕捉到你的车牌，通过 OCR变成文本，然后插入数据库，于是，上图的这个车牌就成了SQL注入。（不要以为车牌的OCR技术还不行，这项目技术已经非常成熟了，无论是国内还是 国外）。这张图片就如同“Web开发中应该知道的事”中说的一样——永远不要相信用户的输入。
近日，来自深圳华大基因研究院和台湾长庚大学的研究人员研发了一种对人类转录组中的RNA编辑位点进行测定和分析的新型计算方法，并发现人类转录组中存在大量的RNA编辑现象，该成果于2012年2月12日在国际著名杂志《自然-生物技术》（Nature Biotechnology）上在线发表。本研究利用最新的RNA-seq技术对人类个体中的RNA编辑位点进行了准确、全面的检测和广泛的分析，对提高研究人员采用新一代测序技术对RNA编辑进行研究及进一步了解RNA编辑与人类发育以及正常或疾病等不同生理状态的关系发挥了重要的作用。
RNA编辑是指DNA转录成RNA前体（pre-RNA）后，RNA序列内一些特异位点的核苷酸发生删除、添加或修饰等变化，使得RNA所携带的遗传信息发生改变的过程。这种改变影响了基因的表达，使得一个基因可能产生几种结构和功能不同的蛋白质。RNA编辑在灵长类进化和高级脑功能的发育等方面被视为重要因素。尽管科学家们已经对RNA编辑修饰机理进行了一些研究，如对遗传信息的改变、对RNA剪接和miRNA调控的影响等，但是对人类中RNA编辑的发生和作用仍知之甚少。因此，准确全面地对RNA编辑位点的鉴定和分析是深入理解转录后修饰相关机制等方面研究的关键一步。
去年5月份，来自美国宾夕法尼亚大学医学院及北卡罗来纳州立大学医学院的研究小组在《科学》（Science）杂志上发表了一篇关于“RNA与DNA序列存广泛差异”的文章。研究人员发现大量的RNA与其模板DNA序列不一致，他们在外显子中发现了超过1万个不同的位点。除部分不一致位点是已知的A到G的编辑类型外，该研究小组还观察到了所有12种可能的编辑类型，这表明mRNA有可能在将遗传信息从细胞DNA携带至蛋白质加工厂的过程中以某种未知的‘RNA编辑’机制进行了重新编辑，并且编辑发生的普遍性远超出原有的认识。如果这一研究发现被证实是真实的，将会导致分子生物学中的“遗传中心法则”被改写。然而，一些科学家对此持怀疑态度，他们认为很大一部分RNA和DNA不一致的位点有可能是研究人员在使用高通量测序仪进行测序时的系统误差或生物信息学分析方法不够严谨导致的假阳性。针对这些问题，华大基因的研究人员研发了一个更加严谨的算法解答读者提出的各项质疑，这将对这一领域的进一步研究带来极大的帮助。
在本研究中，科研人员采用新一代测序技术对已有全基因组测序的“炎黄一号”（YH）样本的类淋巴细胞系进行全转录组测序。通过比较分析，共鉴定出22，688个RNA编辑位点，其中有21，113个位点是由腺嘌呤（A）转变为鸟嘌呤（G）；有1，146个是单碱基之间的转换（包括嘌呤与嘌呤之间的替换或嘧啶与嘧啶之间的替换）；还有429个位点发生了单碱基颠换（嘌呤和嘧啶之间的替换）。目前，这些数据已经在线公开发布（http：//yheditome.genomics.cn/mgb2/gbrowse）。此外，科研人员还在miRNAs中发现了44个编辑位点，表明RNA编辑和miRNA介导的基因表达调控可能存在某种联系。
文章第一作者、华大基因科技合作事业部副总裁彭智宇说：“这些研究结果证明我们的新计算方法和流程能够精准、有效地对RNA编辑位点进行鉴定和分析。该方法在鉴定RNA编辑位点的过程中采用多重过滤方法，有效排除假阳性结果，消除偏差，从而可以准确全面的反映人类全基因组RNA编辑的情况。”
RNA-Seq技术又被称为“全转录组鸟枪法测序”技术，其作为一种新一代测序技术在基因表达定量和基因结构变化检测等方面具有不可比拟的优势。华大基因执行院长王俊教授说：“在这次研究中，我们采用了RNA-Seq技术对样本进行测序，并研发了一套更加精确的新型计算方法去全面、准确地挖掘人的转录组中所存在的RNA编辑位点。我们希望在将来该方法能够被应用于大规模的RNA编辑研究中，为深层揭示RNA水平上基因调控的分子机制提供科学手段。”
Comprehensive analysis of RNA-Seq data reveals extensive RNA editing in a human transcriptome
Zhiyu Peng,1, 5 Yanbing Cheng,1, 5 Bertrand Chin-Ming Tan,2, 5 Lin Kang,1 Zhijian Tian,1 Yuankun Zhu,1 Wenwei Zhang,1 Yu Liang,1 Xueda Hu,1 Xuemei Tan,1 Jing Guo,1 Zirui Dong,1 Yan Liang,1 Li Bao1 & Jun Wang1, 3, 4
RNA editing is a post-transcriptional event that recodes hereditary information. Here we describe a comprehensive profile of the RNA editome of a male Han Chinese individual based on analysis of ~767 million sequencing reads from poly(A)+, poly(A)− and small RNA samples. We developed a computational pipeline that carefully controls for false positives while calling RNA editing events from genome and whole-transcriptome data of the same individual. We identified 22,688 RNA editing events in noncoding genes and introns, untranslated regions and coding sequences of protein-coding genes. Most changes (~93%) converted A to I(G), consistent with known editing mechanisms based on adenosine deaminase acting on RNA (ADAR). We also found evidence of other types of nucleotide changes; however, these were validated at lower rates. We found 44 editing sites in microRNAs (miRNAs), suggesting a potential link between RNA editing and miRNA-mediated regulation. Our approach facilitates large-scale studies to profile and compare editomes across a wide range of samples.
据香港《文汇报》援引外媒报道，美国黄石国家公园一座沉睡了64万年的超级火山于过去7年来以破纪录速度隆起，恐怕会发生史上第4次爆发。若真的爆发，厚达30厘米的火山灰将笼罩1600平方公里的区域，美国将有2/3地区无法居住，航空交通瘫痪，数百万计居民无家可归，植物也可能消失殆尽。
黄石超级火山位于美国中西部怀俄明州西北角的黄石国家森林公园，占地面积近9000平方公里，是世界上最大的活火山。火山整体以黄石湖西边的西拇指(West Thumb) 为中心，向东向西各15英里，向南向北各50英里，构成一个巨大的火山口。
在这个火山口下面蕴藏着一个直径约为70公里、厚度约为10公里的岩浆库，距离地面最近处仅为8公里，并且还在不断地膨胀。从1923年至今，黄石公园部分地区的地面已经上升了70厘米。
2011年1月，科学家们警告称，黄石火山或许已经进入活跃期，据模拟分析显示，一旦该火山喷发将导致灾难性后果。
该座超级火山在过去210万年中总共爆发过3次。科学家自1923年起开始纪录火山隆起速度，单是过去3年每年就上升了7.6厘米，前所未见。由于数据不够全面，研究人员暂不敢断言第4次爆发何时发生，不过若爆发，影响将比去年4月爆发的冰岛火山还要大。
在电影《2012》中，世界末日就是从黄石公园的超级火山爆发开始的。
闲暇无事，上网解闷。无意中发现这个主题蛮有意思，遂下载整理，格式修改成文。缅怀那些为战争而牺牲的将士们！
正文如下（敝人对正文部分只是格式修改，并非本人原创，特此声明）
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写在前面的话
夜光杯，捧在手，千军共饮出征酒。出征酒，味纯厚，豪情壮心似酒流。将军举起杯，士兵也举起酒。出征的酒，饮一口，将军士兵血同流。是生也举起酒，是死也举起酒出征的酒，饮不够，生生世世不回头。
上面这首词是对越自卫反击战时，人民子弟兵上前线喝壮行酒时的壮行歌。1979年2月17日，来自全国各地的几十万大军，正是唱着壮行歌，怀着满腔愤怒，向越南挥起了报复之剑。这里面，大多是不到二十岁的年青战士，其中有不少人，踏出国门之后就再没有踏进他们深爱的祖国。新一代可爱的人，用汗和血再次告诉世人，他们才是当之无愧的民族魂。
也许是因为这世界变得太快，也许是因为我们过于漠然的存在，回首时光阴已三十载。三十年来，我们得到很多，可我们也失去很多。如今，自卫反击、老山、者阴山等曾经让无数国人热血沸腾的字眼已消失了。《再见吧妈妈》、有多少妈妈再也没见到儿子啊；《十五的月亮》、多少情人无法团圆啊；还有那让人无法忘怀的《血染的风采》。
1999年1月28日，首都各界集会纪念江泽民主席八项主张发表４周年和《告台湾同胞书》发表二十周年。
1999年5月4日，五四运动八十周年纪念大会在京举行江泽民等党和国家领导人出席胡锦涛讲话1999年６月28日，中共中央举行纪念中国共产党成立七十八周年座谈会，江泽民发表谈话
1999年10月1日，首都各界庆祝中华人民共和国成立五十周年大会在天安门广场举行，举行盛大阅兵式。
……
1999年2月17日，却是那样的寂寞啊！而2009年2月17日，又马上来到了。
忘记意味着背叛，当我们有意或无意地忘记时，我们就是在背叛我们的历史。而那些掩埋在异国他乡的祖国英灵、那些为了国家利益而捐出年轻生命的忠魂又怎能瞑目。一个不能大胆祭奠为国捐躯英雄的国家，这个国家还是有希望的国家吗？
中越战争对中越两国人民来说都是一个伤疤，揭开这个伤疤需要勇气。但必须揭开，惟有如此才能更好地修复。就让我们打开历史的长镜头，解开尘封的岁月而还原这段历史吧。
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喜欢的话可以下载我整理的WORD文档，链接如下：
Sponsor foreword
In this collection we highlight key publications that have advanced the understanding of microRNA biology and effects on gene regulation. Importantly, as the field has matured and the first microRNA-based drug achieved human proof-of-concept, these papers further link microRNA dysregulation to disease pathogenesis and provide strong validation of microRNAs as promising targets for therapeutics.
Several microRNAs clearly have a role in metabolic pathways. For example, miR-33a/b inhibition in non-human primates raises plasma HDL cholesterol, the ‘good’ cholesterol, and lowers triglycerides (Rayner et al. 2011, p2). Additionally, miR-103/107 can regulate insulin sensitivity and may represent a new target for the treatment of diabetes and obesity (Trajkovski et al. 2011, p11).
Other microRNAs have been linked to developmental processes such as vascular development and bone formation. As an example, miR-132 can facilitate angiogenesis (Anand et al. 2010, p21) and the hemizygous germline deletion of the miR-17-92 cluster causes skeletal and growth defects in humans (Pontual et al. 2011, p16).
Targeting oncogenic microRNAs has emerged as a promising strategy for cancer therapy. For example, tumors can become addicted to oncogenic microRNAs, termed oncomiRs, as shown in an in vivo model of microRNA-21 induced B-cell lymphoma (Medina et al. 2010, p6). Inhibition of miR-182, a microRNA frequently overexpressed in several cancer types, repressed metastasis in a mouse model of melanoma liver metastasis (Huynh et al. 2011, p41), and inhibition of miR-10b inhibits metastasis in a mouse breast cancer model (Ma et al. 2010, p27). Furthermore, miR-380-5p represses the tumor suppressor p53 and was associated with poor outcomes in neuroblastoma (Swarbrick et al. 2010, p34).
We are pleased to bring you this collection highlighting the exciting developments around the potential for creating powerful first-in-class medicines targeting microRNAs.
Kleanthis G. Xanthopoulos, Ph.D.
Regulus Therapeutics President and CEO
Content:
德国莱布尼茨植物遗传学与农作物研究所的Stein博士带领一个国际科研团体，经过两年努力，终于首次观察到谷类作物大麦的全基因组。科学家们借助他们建立的新方法，已能确定大麦全部基因2/3的排序，这些成果成为完整破译大麦与相近的小麦基因组的基础。
根据来自世界粮农组织的信息，小麦与大麦在全球种植最多的谷物排名中分别占据第一和第五位，它们对于经济与科研具有重要意义。科学家们只有在掌握了植物的遗传密码后，才能理解为其复杂性状负责的分子机制。而了解遗传密码也是改善作物重要性能的基础，比如耐旱与抵抗力。
然而谷物基因组极其庞大且构造复杂，这使得完整解码困难很大。Stein博士称，大麦基因组约为人类基因组的两倍半，是水稻基因组的12倍，全部解码需要1亿美元经费。成功测试的新方法现已用来研究更为庞大的小麦基因组。
由于很多农作物具有相似性，研究人员可以将大麦的遗传信息与特征表现之间的关系转用于研究比如黑麦等其他近似的谷类。
原文出处;
The Plant Cell doi: 10.1105/tpc.111.086629
Frequent Gene Movement and Pseudogene Evolution Is Common to the Large and Complex Genomes of Wheat, Barley, and Their Relatives
Thomas Wicker, Klaus F.X. Mayer, Heidrun Gundlach, Mihaela Martis, Burkhard Steuernagel, Uwe Scholz, Hana imkovád, Marie Kubaláková, Frédéric Choulet, Stefan Taudien, Matthias Platzer, Catherine Feuillet, Tzion Fahima, Hikmet Budak, Jaroslav Dole?el, Beat Keller and Nils Stein
All six arms of the group 1 chromosomes of hexaploid wheat (Triticum aestivum) were sequenced with Roche/454 to 1.3- to 2.2-fold coverage and compared with similar data sets from the homoeologous chromosome 1H of barley (Hordeum vulgare). Six to ten thousand gene sequences were sampled per chromosome. These were classified into genes that have their closest homologs in the Triticeae group 1 syntenic region in Brachypodium, rice (Oryza sativa), and/or sorghum (Sorghum bicolor) and genes that have their homologs elsewhere in these model grass genomes. Although the number of syntenic genes was similar between the homologous groups, the amount of nonsyntenic genes was found to be extremely diverse between wheat and barley and even between wheat subgenomes. Besides a small core group of genes that are nonsyntenic in other grasses but conserved among Triticeae, we found thousands of genic sequences that are specific to chromosomes of one single species or subgenome. By examining in detail 50 genes from chromosome 1H for which BAC sequences were available, we found that many represent pseudogenes that resulted from transposable element activity and double-strand break repair. Thus, Triticeae seem to accumulate nonsyntenic genes frequently. Since many of them are likely to be pseudogenes, total gene numbers in Triticeae are prone to pronounced overestimates.
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